Desa Margasari memiliki lahan pertanian yang subur, mendukung budidaya berbagai tanaman hortikultura. Komoditas unggulan meliputi bawang merah, cabai rawit, dan semangka. Selain itu, tanaman biofarmaka seperti jahe, kencur, dan kunyit juga dibudidayakan, memberikan kontribusi signifikan terhadap perekonomian desa.